1950年6月26日成立富顺县防疫委员会,负责全县的防疫工作;
1950年建立县卫生院防疫股,由院长领导,抽调各科室医护人员共同开展卫生防疫保健工作;
1952年7月26日成立“富顺县卫生防疫委员会”,由县长张敏兼主任委员,下设办公室于卫生科;
1956年5月3日遵照省卫生厅指示的精神,县人民委员会以(56)富卫行字第014号文批准,将县卫生院设立的防疫股划出来建立“富顺县卫生防疫组”,成为县级卫生单位;
1957年2月经县人委会同意,撤销“县钩虫病防治队”,其人员合并到县卫生防疫组;
1958年经县人委会决定,按中央卫生部规定的人员编制进行充实,正式建立“富顺县卫生防疫站”;
1969年元月,根据县革委会的批示,将县卫生防疫站、县妇幼保健站与县人民医院合并建立“富顺县工农兵卫生院”,下设防疫组,由四名非业务人员组成;
1970年10月5日,经中共富顺县革命委员会核心领导小组研究决定:将县工农兵卫生院原卫生防疫站、妇幼保健站的全部人员划分出来,建立“富顺县卫生防疫妇幼保健站”;
1973年4月12日,报经县革委会批准,将卫生防疫站与妇幼保健站分开,恢复为“富顺县卫生防疫站”
1990年8月,经县府(90)43号文件批准,卫生防疫站为副局级事业单位;
1994年10月18日,根据富顺县编制委员会富编发(1994)28号文件批复,建立富顺县结核病防治所,与富顺县卫生防疫站实行两块牌子一套人员,负责全县结核病控制项目的实施;
1998年12月22日,根据富顺县机构编制委员富编发[1998]25号文件批复,建立富顺县健康教育所,挂靠在富顺县卫生防疫站内,不新增人员编制和经费。
2003年4月,根据富顺县机构编制委员会富编委发(2003)10文件批复,富顺县卫生防疫站与县卫校合并,更名为富顺县疾病预防控制中心,属正科级全额拨款事业单位,编制80人。
2004年5月,国债项目疾控业务楼动工,新征地2.09亩,拟投资209万元(其中国债100万元,设备9万元)。建筑面积2318平方米,11月主体竣工。
2005年4月,国债项目疾控业务楼装修竣工,科室迁入新办公楼办公。
2005年成立了“艾滋病高危人群行为干预队”,拟建艾滋病初筛实验室。
2006年调整科室设置,设行政科室4个(办公室、财务科、后勤科、质控办),业务科室5个(疾控科、结慢科、艾防健教科、卫生监测科、卫生检验科)。
2014年3月,疾控机构等级评审工作正式启动。
2015年1月,疾控公租房完成建设并投入使用。
2016年4月,档案工作规范化管理被省档案局评为二级单位。
2016年9月,省卫计委正式批准富顺县疾控中心为二级甲等疾控机构。
2017年9月,我县发生一起一般突发公共卫生事件(兜山镇霍乱疫情),病例数1名,无死亡。
2018年成功创建省级健康促进县。10月,心血管高危人群筛查与综合干预项目获全国先进示范点殊荣。
2019年建成全县首家HIV确证实验室,新建了万级洁净实验室和局部百级实验室。
2020年建立市内首家区县核酸检测实验室并投入使用。
2020年安装罗氏核酸检测系统,具备开展HIV-1病毒载量检测的能力。
2022年新增全自动病毒载量分析系统,并开发业务科室-实验室一体化办公信息管理系统。
2023年4月起中心不再承担从业人员预防性健康体检工作。8月底我县被确定为第五轮全国艾滋病综合防治示范区并初步启动示范区工作。
2023年12月我县成功创建慢性病综合防控示范区。